保稅區和綜合保稅區的功能定位不同，涉及的稅收政策也有明顯差別。

保稅區和綜合保稅區雖然都是海關特殊監管區域，但功能定位卻有所不同，特別是對于銷售貨物進入到這兩個特殊監管區域的企業而言，存在如何享受出口退（免）稅的差別。

保稅區是為了發展對外貿易和轉口貿易，借鑒參照國外自由貿易園區而設立的經濟區域，是我國最早出現的海關特殊監管區域。1990年起，為配合沿海開放戰略，國務院在上海、天津、深圳等13個沿海開放城市逐步設立了15個保稅區。保稅區的功能定位為“保稅倉儲、出口加工、轉口貿易”三大功能。

綜合保稅區，是設立在內陸地區的具有保稅港區功能的海關特殊監管區域，由海關參照有關規定對綜合保稅區進行管理，執行保稅港區的稅收和外匯政策，集保稅區、出口加工區、保稅物流區、港口的功能于一身，可以發展國際中轉、配送、采購、轉口貿易和出口加工等業務。2006年12月，國務院正式批準設立“蘇州工業園綜合保稅區”，明確綜合保稅區享受保稅港區的有關稅收、外匯政策。綜合保稅區是在保稅區之后出現的，其功能定位延續了保稅區的特點，但又與其有不同之處。

尤其需要注意的是，保稅區和綜合保稅區均是基于“兩頭在外”的特殊區域定位而設立的，以鼓勵出口為導向，在稅收政策的適用上，兩者既有相同又有區別。

相同之處具體表現在三個方面：一是保稅政策。對保稅區或綜合保稅區內企業為開展加工、物流、服務等業務而進口的原材料、零部件、物料等貨物實行保稅，不征收進口環節增值稅、消費稅和關稅；二是免稅政策。區內貨物自由流轉，不征收增值稅和消費稅。免稅貨物包括基礎設施建設項目所需的機器、設備和其他物資，開展加工、服務、物流等業務所需的機器、設備、模具及其維修用零配件等。除了自用的運輸工具和生活消費用品不予免稅外，區內企業自用合理數量的辦公用品及其所需的維修用零配件，免征進口關稅和進口環節增值稅與消費稅；三是征稅政策。貨物出區進入境內，按貨物進口的有關規定，辦理報關征稅手續。

二者的不同點，更多體現在出口退稅政策上。保稅區實行“離境退稅”政策，綜合保稅區實行“入區退稅”政策。根據《財政部 國家稅務總局關于出口貨物勞務增值稅和消費稅政策的通知》（財稅〔2012〕39號）規定，出口企業經海關報關進入國家批準的出口加工區、保稅物流園區、保稅港區、綜合保稅區、珠澳跨境工業區（珠海園區）、中哈霍爾果斯國際邊境合作中心（中方配套區域）、保稅物流中心（B型）（以下統稱特殊區域）并銷售給特殊區域內單位或境外單位、個人的出口貨物，應視同出口，實行“入區退稅”政策，可以直接申報出口退（免）稅，無須提供出境貨物備案清單。換句話說，出口企業將貨物運送至上述7類特殊區域后，無論是在區內進行銷售，還是出口至境外，都可以申請出口退（免）稅。

通過仔細分析不難看出，保稅區并不在上述7類特殊區域范圍內。這也意味著進入保稅區的貨物不能視同出口，不享受“入區退稅”政策，而是要到實際離境時，才能按照出口貨物申請出口退（免）稅。

通常來說，出口企業通過保稅區將貨物銷售給境外單位、個人的業務模式是：出口企業在與境外單位、個人簽訂買賣合同后，會將貨物運入保稅區，境外單位、個人購入貨物后，將委托保稅區內的倉儲企業代為存放。貨物實際離境時，由倉儲企業為境外單位、個人辦理報關手續。海關在貨物全部離境后，簽發進入保稅區的出口貨物報關單，稅務部門相應為出口企業辦理出口退（免）稅。需要注意的是，保稅區外的企業申報出口退（免）稅時，還須提供倉儲企業的出境貨物備案清單。

（原標題：保稅區“離境退稅”，綜合保稅區“入區退稅”，作者單位：國家稅務總局山東省稅務局、國家稅務總局東營市河口區稅務局 ）